Data catalogue · 数据目录
第一版收录6项优先研究、共57,674个寄生虫细胞。每项均提供论文、原始数据登录号和作者处理结果的直接链接。
细长型 · 过渡型 · 粗短型血流期
细胞数口径: 作者存档过滤矩阵：8,599个野生型 + 2,295个ZC3H20敲除细胞
原始转录本计数
作者UMAP与PCA均可用
TREU927（TriTrypDB release 50）；Lister 427大环DNA M94286.1
图谱仅做格式解码；可选探索性统计为本站派生并独立标注
核验时ENA提供提交的BAM/BAI文件，但未提供FASTQ或SRA FTP链接。Zenodo许可已核实适用于其存档，但尚无证据证明其覆盖独立作者H5AD来源的坐标与元数据。
前循环型 · 上鞭毛体 · 有性阶段 · 后循环型
细胞数口径: 采采蝇来源寄生虫转录组；不含用于方法验证的46个体外前循环型细胞
Smart-seq2整数读段计数；并非UMI计数
388个细胞均有作者fig1 UMAP坐标
T. b. brucei 927基因组；HISAT2 2.1.0与HTSeq 0.7.1
静态浏览格式转换；可选探索性统计为本站派生并独立标注
DP是分选组而非菌株。C5以J10为主、C6以1738为主，阶段与菌株效应可能混杂；388个细胞中有387个匹配当前ENA别名。
血流型 · 前循环型 · 细胞周期
细胞数口径: 作者阶段表：4,366个血流型 + 7,640个前循环型细胞
作者归一化的非负小数表达值；并非原始UMI计数
BSF与PCF使用相互独立的作者UMAP和MNN空间
作者比对参考：T. brucei WT427 2018，3′ UTR延长2,500 bp；同时比对L. major Friedlin以排除multiplet；Cell Ranger 7
仅格式转换；BSF与PCF保持分离
BSF与PCF降维坐标分别计算，不能叠加为同一坐标空间。
后循环型 · 早期皮肤组织型 · 血流型
细胞数口径: 通过质控的寄生虫转录组：44个后循环型、95个皮肤时间序列和31个血流型
皮肤样本归一化小数值与独立的BSF整数计数
论文报告作者PCA，但未存档可复用坐标
TREU927 release 48与ERCC序列
可选样本索引；未重建PCA
GEO审核中未记录独立数据许可
两张表达表的单位不同；本站不合并矩阵，也不重建PCA。
上鞭毛体 · 后循环型 · 锥鞭毛体 · 无鞭毛体
细胞数口径: 经作者质量控制后保留的有效细胞
作者H5AD活动矩阵中的有符号缩放值；并非原始计数
作者UMAP与PCA均可用
作者比对参考：Dm28c 2018、大环DNA及3′ UTR延长2,500 bp；仅AMA/EP/MIX另加入GRCh38。相关UTR资产来自TriTrypDB release 68
解码活动缩放矩阵；未重新分析
数据专用许可尚未独立核实
BioStudies提供IDF/SDRF与原始读段链接，但没有处理后计数矩阵。
无鞭毛体 · 过渡细胞 · 细胞来源锥鞭毛体
细胞数口径: 最终保留3,151个singlet；由3,192个质控后细胞移除41个双细胞得到
两个技术矩阵中的kallisto bustools实数型期望计数
作者最终UMAP与去除双细胞后的元数据未存档
Dm28c 2018（TriTrypDB release 62）与Dm28c大环kDNA组合参考
仅建立溯源索引；未重建图谱
最终UMAP/细胞元数据未存档；论文与公开R脚本的nUMI/nGene阈值不同。SRA的“Axenic culture”字段不能替代感染H9c2的实验来源。