E-MTAB-14406 · ERP163729 · SAMPLE & RUN PROVENANCE

从生命周期样本追溯到每个测序文件

浏览作者提交的8个来源样本、8个实验、25个ENA运行和79个FASTQ条目。样本1–7用于生命周期图谱,样本8是独立的48小时无鞭毛体验证数据。

VERIFIED SDRF · SHA-256f95f4d5470f2208d24db827147bf3302a61c453cbc208301023d078af12a8c54

以下字段来自作者提交的 SDRF;中文阶段名称为本站对应翻译。

Library10x 3′ v3
LayoutPAIRED
SelectionOligo-dT
cDNAR2 · 91 bp
Cell barcodeR1 · 16 bp
UMIR1 · 12 bp
8来源样本
8实验
25测序运行
79FASTQ 条目
25 条记录
01
纳入生命周期图谱

ERR13618077

Cycle_epimast_a_AK938_HYV3LDSX3_S5_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 1 (cycle_epimast)

ERS20928730SAMEA115968800

论文阶段上鞭毛体和感染后 120 小时无鞭毛体

Epimastigote and 120 hpi amastigotes

实验ERX12989002

技术重复组: group 1

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
02
纳入生命周期图谱

ERR13618068

Cycle_epimast_b_AK939_HYV3LDSX3_S6_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 1 (cycle_epimast)

ERS20928730SAMEA115968800

论文阶段上鞭毛体和感染后 120 小时无鞭毛体

Epimastigote and 120 hpi amastigotes

实验ERX12989002

技术重复组: group 1

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
03
纳入生命周期图谱

ERR13618067

Cycle_epimast_d_AK941_HYV3LDSX3_S8_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 1 (cycle_epimast)

ERS20928730SAMEA115968800

论文阶段上鞭毛体和感染后 120 小时无鞭毛体

Epimastigote and 120 hpi amastigotes

实验ERX12989002

技术重复组: group 1

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
04
纳入生命周期图谱

ERR13618071

Cycle_epimast_c_AK940_HYV3LDSX3_S7_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 1 (cycle_epimast)

ERS20928730SAMEA115968800

论文阶段上鞭毛体和感染后 120 小时无鞭毛体

Epimastigote and 120 hpi amastigotes

实验ERX12989002

技术重复组: group 1

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
05
纳入生命周期图谱

ERR13618072

Cycle_amast_a_AK646_HYV3LDSX3_S1_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 2 (cycle_amast)

ERS20928731SAMEA115968801

论文阶段感染后 6 和 24 小时无鞭毛体

6 and 24 hpi amastigotes

实验ERX12989003

技术重复组: group 2

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
06
纳入生命周期图谱

ERR13618066

Cycle_amast_d_AK649_HYV3LDSX3_S4_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 2 (cycle_amast)

ERS20928731SAMEA115968801

论文阶段感染后 6 和 24 小时无鞭毛体

6 and 24 hpi amastigotes

实验ERX12989003

技术重复组: group 2

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
07
纳入生命周期图谱

ERR13618074

Cycle_amast_c_AK648_HYV3LDSX3_S3_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 2 (cycle_amast)

ERS20928731SAMEA115968801

论文阶段感染后 6 和 24 小时无鞭毛体

6 and 24 hpi amastigotes

实验ERX12989003

技术重复组: group 2

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
08
纳入生命周期图谱

ERR13618063

Cycle_amast_b_AK647_HYV3LDSX3_S2_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 2 (cycle_amast)

ERS20928731SAMEA115968801

论文阶段感染后 6 和 24 小时无鞭毛体

6 and 24 hpi amastigotes

实验ERX12989003

技术重复组: group 2

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
09
纳入生命周期图谱

ERR13618069

Cycle_metacyc1_b_AK947_HYV3LDSX3_S14_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 3 (cycle_metacyc1)

ERS20928732SAMEA115968802

论文阶段后循环型锥鞭毛体

metacyclic trypomastigotes

实验ERX12989004

技术重复组: group 3

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
10
纳入生命周期图谱

ERR13618062

Cycle_metacyc1_a_AK946_HYV3LDSX3_S13_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 3 (cycle_metacyc1)

ERS20928732SAMEA115968802

论文阶段后循环型锥鞭毛体

metacyclic trypomastigotes

实验ERX12989004

技术重复组: group 3

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
11
纳入生命周期图谱

ERR13618076

Cycle_metacyc1_d_AK949_HYV3LDSX3_S16_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 3 (cycle_metacyc1)

ERS20928732SAMEA115968802

论文阶段后循环型锥鞭毛体

metacyclic trypomastigotes

实验ERX12989004

技术重复组: group 3

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
12
纳入生命周期图谱

ERR13618064

Cycle_metacyc1_c_AK948_HYV3LDSX3_S15_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 3 (cycle_metacyc1)

ERS20928732SAMEA115968802

论文阶段后循环型锥鞭毛体

metacyclic trypomastigotes

实验ERX12989004

技术重复组: group 3

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
13
纳入生命周期图谱

ERR13618078

Cycle_metacyc2_b_AK931_HYV3LDSX3_S18_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 4 (cycle_metacyc2)

ERS20928733SAMEA115968803

论文阶段后循环型锥鞭毛体

metacyclic trypomastigotes

实验ERX12989005

技术重复组: group 4

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
14
纳入生命周期图谱

ERR13618059

Cycle_metacyc2_d_AK933_HYV3LDSX3_S20_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 4 (cycle_metacyc2)

ERS20928733SAMEA115968803

论文阶段后循环型锥鞭毛体

metacyclic trypomastigotes

实验ERX12989005

技术重复组: group 4

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
15
纳入生命周期图谱

ERR13618060

Cycle_metacyc2_c_AK932_HYV3LDSX3_S19_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 4 (cycle_metacyc2)

ERS20928733SAMEA115968803

论文阶段后循环型锥鞭毛体

metacyclic trypomastigotes

实验ERX12989005

技术重复组: group 4

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
16
纳入生命周期图谱

ERR13618079

Cycle_metacyc2_a_AK930_HYV3LDSX3_S17_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 4 (cycle_metacyc2)

ERS20928733SAMEA115968803

论文阶段后循环型锥鞭毛体

metacyclic trypomastigotes

实验ERX12989005

技术重复组: group 4

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
17
纳入生命周期图谱

ERR13618080

Cycle_trypomast_b_AK943_HYV3LDSX3_S10_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 5 (cycle_trypomast)

ERS20928734SAMEA115968804

论文阶段锥鞭毛体

trypomastigotes

实验ERX12989006

技术重复组: group 5

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
18
纳入生命周期图谱

ERR13618061

Cycle_trypomast_d_AK945_HYV3LDSX3_S12_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 5 (cycle_trypomast)

ERS20928734SAMEA115968804

论文阶段锥鞭毛体

trypomastigotes

实验ERX12989006

技术重复组: group 5

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
19
纳入生命周期图谱

ERR13618073

Cycle_trypomast_c_AK944_HYV3LDSX3_S11_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 5 (cycle_trypomast)

ERS20928734SAMEA115968804

论文阶段锥鞭毛体

trypomastigotes

实验ERX12989006

技术重复组: group 5

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
20
纳入生命周期图谱

ERR13618075

Cycle_trypomast_a_AK942_HYV3LDSX3_S9_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 5 (cycle_trypomast)

ERS20928734SAMEA115968804

论文阶段锥鞭毛体

trypomastigotes

实验ERX12989006

技术重复组: group 5

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码
21
纳入生命周期图谱

ERR13618081

LifeCycleMix1_SCI7T012_SCI5T012_HF552DSX7_S1_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 6 (LifeCycleMix1)

ERS20928735SAMEA115968805

论文阶段后循环型锥鞭毛体、感染后 6/24/120 小时无鞭毛体、锥鞭毛体和上鞭毛体

metacyclic trypomastigotes, 6, 24 and 120 hpi amastigotes, trypomastigotes and epimastigotes

实验ERX12989007

技术重复组: group 6

查看该运行的 FASTQ 文件4 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码I2:第二样本条形码(混合样本)
22
纳入生命周期图谱

ERR13618065

LifeCycleMix1_SCI7T012_SCI5T012_HF552DSX7_S1_L002

在 ENA 打开运行
样本Sample 6 (LifeCycleMix1)

ERS20928735SAMEA115968805

论文阶段后循环型锥鞭毛体、感染后 6/24/120 小时无鞭毛体、锥鞭毛体和上鞭毛体

metacyclic trypomastigotes, 6, 24 and 120 hpi amastigotes, trypomastigotes and epimastigotes

实验ERX12989007

技术重复组: group 6

查看该运行的 FASTQ 文件4 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码I2:第二样本条形码(混合样本)
23
纳入生命周期图谱

ERR13618082

LifeCycleMix2_SCI7T024_SCI5T024_HF552DSX7_S2_L002

在 ENA 打开运行
样本Sample 7 (LifeCycleMix2)

ERS20928736SAMEA115968806

论文阶段后循环型锥鞭毛体、感染后 6/24/120 小时无鞭毛体、锥鞭毛体和上鞭毛体

metacyclic trypomastigotes, 6, 24 and 120 hpi amastigotes, trypomastigotes and epimastigotes

实验ERX12989008

技术重复组: group 7

查看该运行的 FASTQ 文件4 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码I2:第二样本条形码(混合样本)
24
纳入生命周期图谱

ERR13618070

LifeCycleMix2_SCI7T024_SCI5T024_HF552DSX7_S2_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 7 (LifeCycleMix2)

ERS20928736SAMEA115968806

论文阶段后循环型锥鞭毛体、感染后 6/24/120 小时无鞭毛体、锥鞭毛体和上鞭毛体

metacyclic trypomastigotes, 6, 24 and 120 hpi amastigotes, trypomastigotes and epimastigotes

实验ERX12989008

技术重复组: group 7

查看该运行的 FASTQ 文件4 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码I2:第二样本条形码(混合样本)
25
48 小时无鞭毛体验证

ERR14150393

A2_AK2003_HNLWVDSX2_S1_L001

在 ENA 打开运行
样本Sample 8 (amast_48)

ERS22930289SAMEA117601648

论文阶段感染后 48 小时无鞭毛体

48 hpi amastigotes

实验ERX13553051

技术重复组: not supplied

查看该运行的 FASTQ 文件3 FASTQ
R1:细胞条形码 + UMIR2:cDNA 序列I1:样本条形码