PRJNA1200704 · SRR31781067 · ZENODO 18760090
从原始双端测序追溯到作者定量矩阵
核验Inchausti等人的Dm28c混合无鞭毛体和细胞来源锥鞭毛体单细胞研究，并明确区分原始测序、技术重复矩阵、论文结果与公开代码。
FIVE-SOURCE AUDIT · 2026-07-26以下信息分别取自正式论文、SRA/ENA、Zenodo和作者GitHub；不同来源不一致之处会单独标明。
下载机器可读核验清单 ↓01SAMN459101191 来源样本
02SRX271424701 实验
03SRR317810671 运行
04R1 + R22 双端FASTQ
05Matrix 1 + 22 技术矩阵
0682,751共同条形码
073,192质量过滤后
083,151去除双细胞后
- BioProject
- PRJNA1200704
- BioSample
- SAMN45910119
- Experiment
- SRX27142470
- Organism / strain
- Trypanosoma cruzi · DM28c
- 实验来源
- Infected H9c2 rat myoblasts · ATCC CRL-1446
- SRA来源字段
- Axenic culture
- Library
- 10X Chromium · PolyA · PAIRED
- Instrument
- Illumina HiSeq 2500
- Reads
- 882,316,647
- Bases
- 104,995,680,993
SRA的“Axenic culture”是仓库字段，不替代论文中的感染H9c2成肌细胞实验来源。
17Zenodo 文件
440.0 MiBTotal
2Matrix Market
两个技术重复矩阵如何合并
cells_x_genes.mtx82,818 × 19,13216,359,799 non-zero entries
cells_x_genes_2.mtx82,813 × 19,13216,337,978 non-zero entries
82,751 公开R脚本取共同条形码、重新排序并将两个矩阵相加；两个基因列表逐字节完全一致。
Cluster 02201细胞来源锥鞭毛体
C4B63-16g183Cluster 1824无鞭毛体
C4B63-16g155Cluster 2167推定无鞭毛体—锥鞭毛体过渡细胞
论文图注未指定单一标志基因 论文将cluster 2解释为推定过渡细胞；这是转录组推断，并非显微镜直接确认。